早在忽必烈登基的时候，蒙古就已经分裂了，统一的蒙古帝国实际上就已经名存实亡了，各干各的，谁也管不了谁。元朝还在的时候，至少名义上还有个统一的蒙古诸部盟主，也就是元朝皇帝，等到元朝灭亡，就连这个名义上的蒙古共主也逐步不存在了，就基本上分裂了，而且是四分五裂，不相统属。

在明朝也就是鞑靼和瓦剌，唯一一次算是完成了草原统一的，就是瓦剌一度崛起，成为蒙古霸主。实际上，瓦剌并不算严格意义上的蒙古人，只是在成吉思汗西征的时候征服的当地原住民。所以，瓦剌崛起并且一度成为草原霸主，就是蒙古在草原称霸时代的结束，不仅中原守不住，草原也控制不住了。

也先在土木堡之变后试图与明朝达成一个类似澶渊之盟的城下之盟，但是明朝并没有同意，给点钱可以，但是要改变双方的地位，建立一个稳定的、长期的明朝向瓦剌进贡的机制，明朝不接受。这其实也是一个重大的历史转变。因为在与明朝的博弈过程中，尤其是在归还英宗的问题上，蒙古三大分支都在各自私下与明朝联络，不想完全受制于也先。

这才草原和中原持续了近两千年的博弈方式的一次重大转折。按照拉铁摩尔等人的看法，草原游牧部落之所以联合起来，形成部落联盟，并且能够长期维持，一个重要的机制就是必须联合起来，才能一起进攻中原，到中原地区去劫掠，并且最后达成一个稳定而长期的进贡的协议，由部落联盟的盟主来统一分配从中原获得的物资，这是游牧部落联盟国家的君主的一个重要权利。

明朝为什么不愿意接受以前都能够通用的规则了呢？原因也很简单，明朝这时候虽然在土木堡之战中战败了，英宗也被俘了，但是也先的十万军队从大同一路到北京劫掠，却差点被从四面八方赶来的明军堵在长城以南回不去了。因为这时候明朝的长城防御体系已经比较完善了，除了作为防御工事的长城，还有沿长城线屯驻的大量军队和关隘，已经没那么容易突破了。

而且，明朝在长城线以北也不断的向北拓展，主要是通过驻军掩护，内地移民不断向北进行垦荒，所以明朝的北方边境实际控制线并不限于长城线，而是要比长城线更靠北的地方。而这个地带本身也是一个既可以游牧也可以农耕的地区，中原能够控制，就可以变成更低，中原控制不住，就会变成草原游牧民族的上好草场。中原汉人不断在这里垦荒，蒙古人在这里也就没办法待了，只能往北后退。

也因此，在整个明朝，除了也先这一次之外，蒙古没有再形成统一的政权，整个草原都是四分五裂、不相统属的。虽然现在在地图上标记为漠南蒙古、漠西蒙古和莫北蒙古，但实际上只是个大体的分类，实际上并不是统一的部落。相对而言稍微统一点的，反而是漠西蒙古，也就是瓦剌，到晚明到清初的时候，瓦剌四部中的准格尔强大起来，赶走了杜尔伯特部、土尔扈特部和和硕特部，独霸了整个漠西草原，也就是现在的蒙古草原西部和北疆。

也是因为这种草原上缺乏统一的政权，导致了整个草原地区实际上处于权力真空状态。而这个状态一般就会为边远地区的民族和部落的崛起提供机会。更要命的是，明朝在辽东和辽西地区一直不断加强控制，到李成梁时期，通过不断的征讨，将原本在这一带的蒙古部落几乎全部打垮，不仅无法威胁明朝，也无力压制女真在大兴安岭地区的崛起。如果当时辽西和辽北一带的蒙古部落是统一的，也就没有女真什么事了。

女真崛起的过程也就是先统一女真内部，然后和临近的比较强大的蒙古部落通过结盟、联姻等方式，逐步形成了联盟，东部蒙古诸部逐步被纳入了女真主导的这个政权当中去了。之后，再通过与明朝的战争，女真将明军和汉人从辽东地区赶出去，打开了统一整个漠南蒙古的通道，之后就逐步统一了整个漠南蒙古。在后来清朝的政权中，漠南蒙古和女真是始终结盟的，甚至可以说，没有蒙古骑兵的支持，清朝也无力进入中原。

在入关之前，清朝已经和漠北蒙古、准格尔开始有了交往，并且和漠北蒙古大体上达成了同盟，漠北蒙古承认清朝皇帝为草原上的大汗，而清朝则给草原上的贵族们以各种封号，当然，随之而来的是各种定期的赏赐，实际上也就是工资。通过这种方式，蒙古贵族得到了他们以前需要通过劫掠中原才能得到的物资，而清朝则得到了蒙古的支持。即便如此，在康熙时期，漠北蒙古也出现了问题，最后还是通过打仗才解决。清朝和准格尔的战争，更是持续了上百年，一直到乾隆时期才最终解决。