PROTAC技术靶向降解BTK

时间:2022-03-11 17:22:20   热度:37.1℃   作者:网络

非霍奇金淋巴瘤(Non-Hodgkin’s lymphoma, NHL)是一种B细胞恶性血液肿瘤。目前,利用药物(如 Ibrutinib)抑制BTK[1]激酶活性是治疗NHL的重要方法。但是,由于抑制剂与BTK结合位点的突变,使得很多淋巴瘤病人对Ibrutinib的治疗方案产生耐受,这就对寻找新的治疗方案提出了迫切要求。

PROTAC(Proteolysis-targeting chimera)是新兴的利用化合物降解靶向蛋白的方法[2]。PROTAC技术利用细胞内天然存在的蛋白降解途径-泛素化蛋白酶体途径(Ubiquitin proteasome pathway)来清除需要被降解的特异蛋白。细胞内结构或功能异常的蛋白通过一系列酶(泛素化酶 E1,E2,E3)的作用,被标记上多泛素化,随之被转移到蛋白酶体里进行降解[3]。一个PROTAC分子包括两个关键的结构域:与需要降解的靶蛋白特异结合的结构域、与E3泛素化连接酶结合的结构域,二者通过特定的连接子相连(如图1)。PROTAC分子通过上述两个关键结构域将需要降解的蛋白与E3泛素化连接酶连接起来,从而实现靶蛋白的多泛素化和蛋白酶体降解。

图1. PROTAC 技术示意图

近期,有两组科学家都利用PROTAC技术研制出了可以靶向降解BTK激酶的化合物,他们的研究成果分别发表在国际顶级期刊PANS[4]和Cell Research[5]。他们设计的靶向降解BTK的PROTAC分子结构如图2所示,该PROTAC由结合BTK的配体、连接子(linker)和结合CRBN(cereblon,E3连接酶的重要组分,介导E3与底物结合)的配体构成。

图2. PROTAC 靶向 BTK 分子示意图

AdelajdaZorba团队[4]设计了拥有不同长度的连接子的靶向降解BTK的PROTACs分子,并用WesternBlot检测了细胞水平PROTACs对BTK的降解效率,结果发现PROTACs分子在1h左右的时间即可开始对BTK有明显的降解作用,且BTK的降解作用对PROTACs分子有明显的剂量依赖作用(图3)。

图3. PROTACs分子降解BTK

此外,他们还研究了连接子的长度对于PROTACs分子与靶蛋白及E3连接酶结合形成三元络合物的效率关系,发现在一定范围内,较长的连接子对于三元络合物的形成更有利(图4)。

图4.不同linker长度对BTK-PROTAC-E3三元络合物形成的影响

YonghuiSun团队[5]设计的BTK特异的PROTAC分子不仅可以靶向降解野生型的BTK蛋白,同时也可以高效的降解对Ibrutinib耐受的突变型BTK蛋白(图5),可以为ibrutinib耐受的NHL病人提供新的治疗思路。

图5. PROTAC在多种细胞系中降解BTK[5]

PROTAC利用细胞自身的蛋白质降解机制-泛素化蛋白酶体途径来靶向降解特定的蛋白,除了上述两组科学家发表的成果,目前还在诸多其他蛋白(如BET、ER、AR等)的降解中取得了进展。此外,PROTAC技术可以很好地解决很多不可成药(undruggable)的靶点如转录因子等的靶向降解问题,在以后的靶向治疗中将会发挥重要作用。

参考文献

[1]Davis, R. E.et al.Chronic Active B-cell-receptor Signalling in Diffuse Large B-cell Lymphoma.Nature 463, 88–92 (2010).

[2]Carmony KC,Kim KB.PROTAC-Induced Proteolytic Targeting

Methods MolBiol.2012;832:627-38.

[3]RoetenMSF,et al.Positioning of proteasome inhibitors in therapy of solid malignancies.Cancer ChemotherPharmacol.2018 Feb;81(2):227-243.

[4]Zorba A,et al.Delineating the role of cooperativity in the design of potent PROTACs for BTK.Proc Natl Acad Sci U S A.2018Jul 31;115(31):E7285-E7292.

[5]Sun Y, et al.PROTAC-induced BTK degradation as a novel therapy for mutated BTK C481S induced ibrutinib-resistant B-cellmalignancies.

Cell Res. 2018Jul;28(7):779-781.