Nat Genet:食管鳞状细胞癌的突变特征研究

时间:2021-10-28 06:01:39   热度:37.1℃   作者:网络

食管癌作为全球第六大最常见的癌症相关死亡原因,食管鳞状细胞癌(ESCC)是其最常见的一种亚型。既往研究显示,ESCC的发病率在全球范围内存在着显著差异,大多数病例发生于低收入和中等收入国家。

流行病学研究已调查并确定了ESCC的几个潜在环境和生活方式风险因素,包括吸烟和饮酒等因素。尽管对于ESCC环境风险因素的研究已有所进展,但目前认为其不足以解释观察到的发病率差异。因此推测未知的外源性暴露也可能是其发病的原因。

既往对人类癌症和正常组织突变过程的研究表明,外源性突变暴露和内源性过程均会产生独特的突变模式,称为突变特征。虽然一些已知的突变特征具有完善的生物学机制,但对于其他特征的相关病因仍然未知。

ESCC发生率及相关数据收集

在该研究中,研究人员通过将全基因组测序和突变特征分析与癌症流行病学数据相结合,分析来自具有不同疾病发病率的八个国家的552个ESCC基因组,旨在鉴定驱动ESCC全球发病率差异的相关因素。

ESCC危险因素与突变特征之间的关联性

在所有研究的国家中,疾病的相关突变谱相似。研究人员发现,烟草、酒精、鸦片和种系突变的特定突变特征与ESCC风险因素之间具有关联性,而对突变负担的影响不大。并没有发现外源性暴露能够解释ESCC发病率差异的相关突变特征证据。进一步的研究显示,APOBEC相关的单碱基替换(SBS)突变特征SBS2和SBS13分别出现于88%和91%的病例中,占突变负荷的25%,表明APOBEC的激活是ESCC肿瘤发生发展的关键步骤。


总而言之,在该研究中虽然没有发现任何可解释发病率差异的突变特征证据,但也提出了ESCC发病风险因素的相关机制见解。APOBEC的突变激活或许是大多数ESCC肿瘤发生的强制性步骤,这也为进一步的研究驱动APOBEC激活的相关因素,以及ESCC发生发展提供了一定的理论基础。


原始出处:

Moody, S., Senkin, S., Islam, S.M.A. et al. Mutational signatures in esophageal squamous cell carcinoma from eight countries with varying incidence. Nat Genet (18 October 2021).

 

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